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sed -n '1~4s/^@/>/p;2~4p' ./*.fq > ./TrnlTest16S.fa
vsearch -derep_fulllength --input TrnlTest16S.fa --output uniqueSequences.fa --sizeout --sizein
| Code Block |
|---|
vsearch --derep_fulllength $s TrnlTest16S.fa \
--strand plus \
--output $s derep.fa \
--sizeout \
--uc $s.derep.uc \
--relabel $s. \
--fasta_width 0 |
...