...
sed -n '1~4s/^@/>/p;2~4p' ./*.fq > ./TRNL_Test_16STrnlTest16S.fa
vsearch -derep_fulllength --input TrnlTest16S.fa --output uniqueSequences.fa --sizeout --sizein
...
...
sed -n '1~4s/^@/>/p;2~4p' ./*.fq > ./TRNL_Test_16STrnlTest16S.fa
vsearch -derep_fulllength --input TrnlTest16S.fa --output uniqueSequences.fa --sizeout --sizein
...